mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCCTTGTTGCAAACCTCACGC GTGTGTTTTGTGACAATGAGAT CTGTGGAGCATTGGACATTGCCGGTGTGTGTTTTGTGACAATGAGATTTAATAGTTTAAGTTCATCCCCTTGTTGCAAACCTCACGCTGGCGGTGTTTCCGA 9 0 3' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-988 2e-49 cqu-mir-988 0.0000000003 -39.1 ...((((......(((((((((((((((.(.((((..(((((((.((((((....)))))))))).....)))..)))).).))))))))))))))))))). (-39.10)