mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGATGTGACGTAGTGGTAC GCCGCTACGTTGCTTTCACTTG GGACAGTACAGTGGCCACGGGGGTACGCCGCTACGTTGCTTTCACTTGGTACGCTCGTATAGTATAGAGCTAAAAGTAAACATAGATCCATGTGATGTGACGTAGTGGTACCCTCCCGTGTCTATCACAAC 6 1 3' arm Anopheles_gambiae mirbase 100 aae-mir-989 0.0000000004 -50.5 .....((...((((.((((((((...((((((((((..(..((((.(((...((((..........)))).....(....)......))).)))).)..))))))))))...)))))))).)))).))... (-50.50)