mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAGCTCGTTTCTATAGAGGTATCT CTACCCTGTAGTTCCGGGCTTTTG TGCGCTCCTCCGTGACCTACCCTGTAGTTCCGGGCTTTTGTGGGTTGAAATATTATACATATATAATCTCATATACGCTTATCAGAAGCTCGTTTCTATAGAGGTATCTCAGGGAGTGAA 5 1 3' arm Anopheles_gambiae mirbase 100 aae-mir-993 3e-17 -42.8 .....((((((.(((..((((((((((...((((((((((((((((((...((((((....)))))).))).....))))).))))))))))...)))))).))))..))).)))).)). (-42.80)