mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGATCTACTTCATACCCATG TGGGTATTTTAGATCATCGACA GCTACGATCGTGGGTATTTTAGATCATCGACAGACCAAGGCACTTTCGTCACTGGCATTGTAAGGCCGAGCAGATGCGGCCTCAACCCAAACCCTCACCCGTGGTTCGCATCTGCTCCCGTCCAGTGCCCTGTCCAACCATACTGTCAGATCTACTTCATACCCATGAATGGTGGCG 3 4 3' arm Anopheles_gambiae mirbase 100 aae-mir-1174 0.0005 -72.23 (((((.(((((((((((..((((((...(((((.....(((......)))...(((((((...((..((((((((((((((.(.................).)).))))))))))))))...))))))).............))))).))))))....))))))))).)).))))). (-72.23)