mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATCACAGGCAGAGTTCTAGTT TGGAGCTCTGGCTGTGACTTGTG ATGGAGGATAGCCGTACCCTGATGGAGCTCTGGCTGTGACTTGTGTGTTAACTGAATTAAAATCACATCACAGGCAGAGTTCTAGTTAGGTAACGGTTTCAAACAACA 1 3 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-11 9e-39 tca-mir-11 0.000005 -46.2 .((...((.((((((..(((((((((((((((.((((((..((((..((((.....))))...)))))))))).)))))))))).)))))..))))))))...))... (-46.20)