mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACAGGCTAGATTCTCTGGTAT GTAAAGCCTGCCGCGTCGCCGGTCCCCTGAGACCCTAACTTGTGACGTCGCGACCGATATCTCACAGGCTAGATTCTCTGGTATTGGCGATGAGTGCTGCCTTTTGC 5 1 5' arm Apis_mellifera mirbase lin-4 8e-33 nlo-mir-125 5e-43 -42 (((((((..(((.((((((((((.((..((((..(((.(((((((.((((....))))...))))))).)))..)))).)).)))))))))).).)).))..))))) (-42.00)