mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTGTTCTACCTTACAGTGAG CACTTTAAGTTCGAATACCAAGC GGAGAGGGAGAGAGACGAGGATGCACCGGGGCCGGTTCACTTTAAGTTCGAATACCAAGCCTGTCTATAAACAGTTTGGTGTTCTACCTTACAGTGAGTCGACCGTGGTATCGTCGACGTTCCAACA 5 0 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 api-mir-971-1 0.0001 -51.5 ...(..((((...(.(((.(((((..(((...((..(((((.((((...(((((((((((.(((......))))))))))))))...)))).)))))..)).)))..))))).))).).))))..). (-51.50)