mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATACATACTCGTCT GCGAGTATGAATGTGGTGCACG AAACAGATAATTCCATAGGCGAGTATGAATGTGGTGCACGTTTTGATTTATTTCGTGACTAGATACATACTCGTCTACGGTAATCTGTTTT 2 1 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-996 2e-45 tca-mir-279d 0.0003 -37.22 ((((((((....((.((((((((((((.((.((((.((((.............)))))))).)).)))))))))))).))..)))))))). (-37.22)