mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATTGTCTTGTCACAGCAGT TGGTGTGATGGGACATTGTCC ACGTCGCCGGGGATATTGTCTTGTCACAGCAGTACGCCTTTAAAGAGTTACTGGTGTGATGGGACATTGTCCTCGTCCCGTGGCCCTTCGT 4 0 5' arm Apis_mellifera mirbase 100 aga-mir-1000 0.0003 -42.7 ..(((((((((((((.(((((..(((((.(((((.((((....)).))))))).)))))..))))).))))))))....)))))....... (-42.70)