mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAATGCCCTTCGAAATCCCAAA TGGGGTTTCTATGCGGCATGTGCC AGGTTGGAGTTCGTTGCGGCAGGGTTGGGGTTTCTATGCGGCATGTGCCTTGCTTTGAGAAATGCAATGCCCTTCGAAATCCCAAAAATGTCCAACGCTTATCAACA 4 2 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 bmo-mir-2788 0.00008 -40.2 ..(((((.(..(((((.((((...((((((((((...(.(((((.((((((.....)))....)))))))))...))))))))))...)))))))))..).))))). (-40.20)