mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCAGTAGTTACCTGGT CGGAGGAACTCTTGCTGTGATATG ACTCCAGAAAATTTAGATGAAAGAATTCGGAGGAACTCTTGCTGTGATATGTTGCCGTAAAAGATTCATATCACAGCAGTAGTTACCTGGTATTCTTTCGCCTTTCTTCACCTTTACCAAGGAGC 3 1 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 aae-mir-2944b 0.00002 -38.41 .((((((((.....((.(((((((((((((.(.((((.(((((((((((((...(.......)...))))))))))))).)))).))))).))))))))).)))))).............)))). (-38.41)