mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATCTCATGCGGTAACTGTGAG CATATTACCTCGTGGGGTTTCC TTTGGTAGCGTTGGAGTGGGTAATCTCATGCGGTAACTGTGAGTGTGTGAATTGTAAAAGCTCATATTACCTCGTGGGGTTTCCCACCCGTTACCATTA 2 1 5' arm Apis_mellifera mirbase 100 nvi-mir-3477 0.0000000000003 -45 ..(((((((...((.(((((.(((((((((.(((((.(((((((...((.....))...)))))))))))).))))))))).))))))))))))))... (-45.00)