mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCCTGTCCTGTCCCGATAG ATCGGATCAGGATAGGGTAGGGCA TTGAAAGTCGTTCCCGATTTACATTATCGGATCAGGATAGGGTAGGGCAGGGCCATTTCGGTATAACCATTCTGTCCCCTGTCCTGTCCCGATAGTGAGAATCGGTACTGAATCGAAATTATGAACGACTGTTTATTCAT 2 3 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 ame-mir-3718b 2e-58 -58.02 .(((((((((((((((((((.(((((((((..((((((((((...(((((((((.....)))........))))))))))))))))..))))))))).))))))).................)))))))).....)))). (-58.02)