mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACGGTGATGAGTTTAAACAG TTTGTAGAGTCATAGTTACGCTGAGTATGA CTGAGGTTCATACGGTGATGAGTTTAAACAGTTTACACCCGAGTCTGGTTTCGATCGAACCTCAATTTTCTGGGGATCTCGTTCCAGATTATGAAAGAGTAAACGTTTGTAGAGTCATAGTTACGCTGAGTATGAACTTC 5 7 5' arm Apis_mellifera mirbase 100 100 -44.82 ..(((((((((((((((((((.((((....((((((.....(((((((...(((..((.(((((......))))).)))))..)))))))........)))))).....)))).)))).....))))..))))))))))) (-44.82)