mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCGGAGAGGAAGGTATGCGT GTTTACAGTACAATATTTTCTTTGTTTT CTTTCGGATCTTCTTCTCTGACAAGTTTACAGTACAATATTTTCTTTGTTTTTTTTTCTTTTTATGAGGCACAAAGCGAGAAGAAACGCGGAGAGGAAGGTATGCGTGTCGAGAGAACAGATGCCTCGAAAA 4 7 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 100 -34.4 .((((((((((..((((((((((.((.....((((....(((((((((((((((((((.((((.((...)).)))).))))))))).))))))))))..)))))).)))).)))))).))))...)))))). (-34.40)