mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACATTTCTTCCCTGGGA TGCGAGGAGGAAAGCTCTCTTTTATT AATGAAAGGTCTGCGAGGAGGAAAGCTCTCTTTTATTAAACGAAAAATTGGATCGCGCTTGTCGGAATGCAATATTTCGACGGATTCATTTGGTGGAAACATTTCTTCCCTGGGAAAAAATTCAA 4 4 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 100 -27.9 ..((((...(((.((.((((((((......((((((((((........((((((.....((((((((((...))))))))))))))))))))))))))...)))))))).))))).....)))). (-27.90)