mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGTCGAGCTTGTGTGTGGAA CCAGCGCGTCAAAAATTGCTTCAATTTTGT CATCACGCGTTATATAGGGAATCGATAAAACGAGTCGAGCTTGTGTGTGGAAACGTTCTAACAACATTGTGGAACAAACCAGCGCGTCAAAAATTGCTTCAATTTTGTAAATATCGACAGGTTTTGTAACCCGTGATT 4 9 5' arm Apis_mellifera mirbase 100 100 -34.74 .((((((.((((((.......((((((..(((((..((((((((((((((....((((((.((....))))))))...))).)))).))).....))))....)))))...)))))).......)))))).)))))). (-34.74)