mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGGTTACCGGAGTTA AGTAGATTGGTTAATTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTATTACTGACGTCATAAAGCTAGGTTACCGGAGTTAAGTGCCGTCTACA 3 0 5' arm Bombyx_mori mirbase mir-9 0.000000000005 ame-mir-9a 2e-20 -37.3 .((((((.(((...(((.(((((((.((((((((.(((((((.......)).))))).)))))))).))))))).)))..))))))))). (-37.30)