mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCATTTTTGACGAGT TCGTAAAAATGGCTGTGTCGTG GTCCATGGCCCACTCGTAAAAATGGCTGTGTCGTGTAGCAACCCTCATATCACAGCCATTTTTGACGAGTTGGGCTGTGT 3 1 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-2 6e-30 nvi-mir-13b 0.000000001 -43.5 ...(((((((((((((((((((((((((((..(((.((.....)))))..))))))))))))).))))).))))))))). (-43.50)