mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTACTAGGTGACTCTGA AGAGCCGCCTCGTGCCTCAGC CCGCGGGAGACGGAGGCGGGCGGCCGCCTCAGGTACTAGGTGACTCTGAGTGGTGCCGGTCTCAGAGCCGCCTCGTGCCTCAGCGCGGGCTCCGCCGACACGTCCGCC 3 0 5' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-306b 1e-37 -61.9 ..(((((....(..((((((.(.((((((.((((((.(((((.(((((((((....))..))))))).))))).)))))).)).)))).)))))))..)...))))). (-61.90)