mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTTGAGTTCTGGATCTGGA ATCTCTAAACTCAAAGTGG TTCTTTGCCTTATCTCTAAACTCAAAGTGGTACCAGCAGTGTGGATGGTCATCTGGTCGTTGCCGTGTTTGAGTTCTGGATCTGGAGCGTATGTGG 5 2 3' arm Bombyx_mori mirbase 100 bmo-mir-2772a-1 7e-45 -21.8 .....((((((...((((((((((((..((((((((..(((........))))))))....)))...)))))))).))))....))).)))..... (-21.80)