mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTACTGAGTGACTCTCAG GTGAGCACCTCGGTACCTTGGC TTGGCTCAGGTACTGAGTGACTCTCAGCGTGATACCATTTCCAGTTCCTGTGAGCACCTCGGTACCTTGGCC 2 2 5' arm Culex_quinquefasciatus mirbase mir-306 0.0009 aae-mir-306 0.00001 -29.8 ..((((.((((((((((((.(((.(((.(....((........)).)))).))))).)))))))))).)))) (-29.80)