mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCT ATACACCCTGTGCTCGCT GAGGAATTTCGGCTACCGGGATACACCCTGTGCTCGCTTTGCATTCGAAACTAGTGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGTGGCCCTGATCCGA 1 3 3' arm Culex_quinquefasciatus mirbase mir-317 3e-41 aae-mir-317-1 7e-45 -37.74 ..(((.((..((((((.(((((((((((((((.(((((..............))))).)))))..))).))))))).))))))..))))).. (-37.74)