mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGATGTGACGTAGTGGTAC GCCGCTACCTCGCTTTCACTTG ACTCGGTCATGGGGAAACGCCGCTACCTCGCTTTCACTTGGTGGCCATAGATTTCGATATCCCATGTGATGTGACGTAGTGGTACCTTCCCTTGGCTATTCC 5 1 3' arm Culex_quinquefasciatus mirbase 100 aae-mir-989 2e-20 -38.3 ....(((((.((((((..((((((((.((((..((((.(((.((.....(....)....))))).)))).)))).))))))))...)))))))))))..... (-38.30)