mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATAAAATATATATATTCCTGA AGAGAGTATATTGATTTTAGGTG TTCTTTGTTTTTATTCCCTGTCAGAGAGTATATTGATTTTAGGTGGACATTTGCGACCATATAAAATATATATATTCCTGATAAAGAATATTTAATATATCT 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4974 6e-27 -25.7 .....((((..(((((..((((((.((((((((..((((((.((((.(......).)))).))))))..))))))))))))))..)))))...))))..... (-25.70)