mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCTTG AGGGTTGCGACTGGGCATCGCG TAATTCGATTTTTAGCTATGATTGTCCAAACGCAATTCTTGTTGATATTCAATATTCAAGGGTTGCGACTGGGCATCGCGGCTCGAAATAAGAATAC 2 1 5' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-219 7e-24 der-mir-219 3e-50 -34.6 ..((((.(((((.(((..((((.(((((..((((((((((((((.....)))....)))))))))))..)))))))))..))).)))))..)))).. (-34.60)