mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTCGAGCCAATAAGTTCGG GTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACC TCGTAACTTGTGTGGCTTCGAATGTACCTAGTTGAGGAAAAACCCCATGTCGGATTTTGTTACCTCTGGTATTCGAGCCAATAAGTTCGG 1 5 3' arm Drosophila_yakuba mirbase mir-314 1e-28 der-mir-314 3e-41 -29.4 .((.(((((((.(((((.(((..(((((.....((((.((((.((......)).))))....)))).)))))))))))))))))))))). (-29.40)