mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGT AGGGAGCCACTCTGCGTTCACT CTCGGAGAACAGGGAGCCACTCTGCGTTCACTCGGTAAGTAAAGAAGCGGGTGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGTTTTCTGAGGGC 2 3 3' arm Nasonia_giraulti mirbase mir-317 7e-36 nvi-mir-317 6e-42 -42.8 ((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(.........).))))))))).)))..)))))).)))).))))))))))... (-42.80)