mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGT TGACTTCGGTGCGTGCTGGG ACACGAAGAATTAAGATAGCAGAGGTACTGACTTCGGTGCGTGCTGGGGTTACCGATCAAGCGCCTAGCACCATTTGAAATCAGTACTACTCGTCTTAG 1 2 3' arm Nasonia_vitripennis mirbase 100 ngi-mir-29b 2e-48 -36.6 ...........((((((.(.((.((((((((.(((((((.(((((((((((........))).)))))))))).))))).)))))))).))))))))). (-36.60)