mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTACTCCCTCCGTACCTATA TAAAAACGGAGGGAGTAGTCGAG TGTCTTGCTAGCTCGTGTCTACGTACTCCCTCCGTACCTATATATTTAACNCCGTTAATTTTTTTAATATATTTGACAGTTTATCTTATTAAAAAAATAAAAAAATATTTTTTTCTTATTATTAAATATGTTTTTATTATATANANAGTTTTACATATTTAAAAAAATTAAATAAAATAAACGATTAAATATATTTAAATAAATTAACGGCGTTAAATATTTAAAAACGGAGGGAGTAGTCGAGGTCGCCATGCGTGCAC TCGGCGGCCCGGCCGGCGAATGGTCGACGGCGGCGCCGGTGCCGCTTGATTGCTTGCCTTGTTGTCTTGCTAGCTCGTGTCTACGTACTCCCTCCGTACCTATATATTTAACNCCGTTAATTTTTTTAATATATTTGACAGTTTATCTTATTAAAAAAATAAAAAAATATTTTTTTCTTATTATTAAATATGTTTTTATTATATANANAGTTTTACATATTTAAAAAAATTAAATAAAATAAACGATTAAATATATTTAAATAAATTAACGGCGTTAAATATTTAAAAACGGAGGGAGTAGTCGAGGTCGCCATGCGTGCACTCCTGCATGCATGCATGCGTGGTGGTGGTGTGTGGANACGATGATATTGGTGTCGGCNGTGTATCATTTCAGTTGCCGATCGATTTACGGCTGATGGTGTCGTTGACCATACAACTGTTTGGTGACTGAGGGAAATATATGTAACGTGTGTCCATCGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 2 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 0.000000000001 100 -69.9 .....(((..((..(((.((.((((((((((((((...((.(((((((((.((((((((((.((((((((((((((..((((((.(((((.((..(((((.((((.....)))).))))).((((((((((.....................)))))))))).....)).))))).))))))..))))))))).))))).)))))))))).))))))))).))...))))))))))))..)).)).)))...))..))). (-69.9)