mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGCACTGGTAGAATTCACTG GTGATTCACCGGTTCCAAACT ATTGAATTGCTGAAACTGCTCTTGGCACTGGTAGAATTCACTGCTAAAAAATACTCCAGTGATTCACCGGTTCCAAACTCGGTTAGCACAATACATCAAAG 2 2 5' arm Lottia_gigantea mirbase mir-183 0.0003 cte-mir-182 0.000001 -28.52 ((((...(((((..((((...((((.((((((.((((.(((((.............))))))))))))))).))))...)))))))))))))......... (-28.52)