mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCGTAGGCGTTGTGCACAG GTGTATTCCCCCTAAGCATCA GACAGGAATAAGGTTTTTGCGTAGGCGTTGTGCACAGTTAAATAGATATTGTGTATTCCCCCTAAGCATCAAATTTTATTACTAGA 5 0 5' arm Lottia_gigantea mirbase 100 spu-mir-242 0.00002 -25.1 ...((.((((((((((.(((.((((.(..(((((((((.........)))))))))..).)))).)))..)))))))))).))... (-25.10)