mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCC CGCTCGGGCAACAATCAACTAA ATTAACATTATCTTCTCAAATTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCCGTAATGTTTAACTCCGGCGCTCGGGCAACAATCAACTAATGATGGAGGTATGAAGTCA 4 1 5' arm Lottia_gigantea mirbase mir-315 0.00000009 aae-mir-315 0.000000005 -34.32 .....(((.(((((((((....(((((((((((((.((..((((.............))))..)))))))))))))))....))).)))))))))...... (-34.32)