mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGACAGTGTGTCCTCCCTTG GGGGAAGTCACTCTCGTCTCCATG CTCTCAGGGGAAGTCACTCTCGTCTCCATGCCCCGATATCAGCATGAGACAGTGTGTCCTCCCTTGAGTGA 3 2 3' arm Lottia_gigantea mirbase 100 cla-mir-1994 0.00001 -32.8 (.(((((((((.(.(((.((.(((((.((((..........))))))))))).))).).))))))))).). (-32.80)