mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTTTGATTGCC CAGCCAAAGTGACTCAGGTATG GCTCCCTGAGACCCTTTGATTGCCTTGTTATTACAATACTGTACATAACATGATCAGGCAGCCAAAGTGACTCAGGTATGCA 6 0 5' arm Schistosoma_mansoni mirbase 100 sja-mir-125a 0.0000002 -30.9 ((..((((((.(.(((((..(((((((((((((((....)))).)))))).....)))))..))))).).))))))...)). (-30.90)