mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTAATAAGACGAACGGTCA ACCATTCATCTGATTCAGAAA ACCTCCGATATTGGACGCCATGACTTTTTTAAATAGAGGTGACCATTCATCTGATTCAGAAACTTTTGTAAATATGTAAAACGATATATATAGACATAAAAATATATTTAACAATAAATCAAATGATAGGAAAAGATTAATAATTACTGATATTTTTTTTTAATAAGACGAACGGTCAGCATATTTAAAAAAGTCAACTACGTCAAATATTTTGGGA ACCTCCGATATTGGACGCCATGACTTTTTTAAATAGAGGTGACCATTCATCTGATTCAGAAACTTTTGTAAATATGTAAAACGATATATATAGACATAAAAATATATTTAACAATAAATCAAATGATAGGAAAAGATTAATAATTACTGATATTTTTTTTTAATAAGACGAACGGTCAGCATATTTAAAAAAGTCAACTACGTCAAATATTTTGGGACGAAGGAATATTATGGTGTGGGTTTCAGACTTTTTAGGTTGTTTCTCAAGATATGCATCATTCCATACTGCGGCTATATGCATGGTTTGAGTTTTAGCTATTCCTTCAAGTATTCTATTTACCCTGGTCATGTCTTAATAAGGCTACATATGTTACTCACGATTTGTAAATTAAACACGTTTAGTCCTTCCTCAGTATAATATCCATGCATATTCCATTGTTCTTC 4 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 3e-62 osa-MIR806h 3e-18 -44.1 .(((..((((((.((((...(((((((((((((((...((((((.(((.(((.(((.(((((.((.(((..(((((((......)))))))..))).))((((((...(((..((.((((..............)))).))..)))...))))))))))).))).))).))).))))).).)))))))))))))))....)))).))))))..))). (-44.1)