mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTCCCACACCTCCCATCCC GATGGGTGAGTTGGGAAAATA GGGAAGAAGACTGGACTGGGGGAAGTCTTGGAGATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCCTAAGATTTTCTTCAGTTCCTTCCTCTCTT GAGGGAAGAAGACTGGACTGGGGGAAGTCTTGGAGATGGGTGAGTTGGGAAAATAATAACTTTCTTCACGAAAGAAAGCAATTTTTTTCCCACACCTCCCATCCCTAAGATTTTCTTCAGTTCCTTCCTCTCTTTACCTGCCTTTCGCTACTGTTTTGGTAAGTTCACTGTTCTCTCCTTCTTCAAAGCCCCCTTTTTTTTCCTCATATATATATATATATAGATATATTTAACACCAAGCGCTTTATAGGCTCAGATCTAGTATTAGATGGATGAAAAAGGTAGTCTATTTGATGATATATTATTTATTTTAAGTGATTAGCAATTGATGTGAGATCTAATCACATTAATATTTGTTTCCATGGGGTGTATATTTTTTTTTTCCCCCTTGAAATTAGAACATTATAAGCCTTAACTTTTGGTAAGGGTATATCAATGAGTAATATAGAAAGGAGAAAATTGCTTGCTTTTTATATACGTTATTTAATGTTAAAGCATGTATCATTGAAACTCGGAAAGGATCTCTTCTTCTCTTTGGAGGGTGCTGCAAATTTTCCAAACACTAGTTTTAGGATGTTATCATTATAATATCTTACAGCTTCATCCAGCGGTTTTACTGTTAATTTTGCATGTTCCAATTTGGTCGCGGGATACATTTTGCGCTGTAGGATAAGTCTTTGGCAAATATAAAGATGGATACAACTAAAACAAGAATATTTATAATGCGTGCCTTTAATCCAACAGGAATATATAATTGTACTCGTGCTATAAACAATCCCCCAAATTTCATCTCAATATGGCATTCATCTTTGTTG 3 2 3' arm Citrus_sinensis mirnest 100 csi-MIR472 2e-33 -55.1 ((((.((((...(((((((((((((((((((.((((((...((((((((((.(((..(((((((.....)))))))..))).)))))))).))..)))))).))))))))))))))))))))))).)))).. (-55.1)