mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCGATAAAGCTTCCCCCTGC AGGGGGAAGCTTTATCGGAAT GGCCTACATACGGTTGGTGGGCGTGATCAGCAGGGGGAAGCTTTATCGGAATTCGATGTGCAGGGCGTGTGGGCACATGCCCTGCACATCGATTTCCGATAAAGCTTCCCCCTGCTGATCACGCCCACCAACCGTATGTAGGCC 0 0 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirbase 100 cre-MIR906 4e-78 -148.7 (((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((....)))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))) (-148.70)