mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATNTAAGTCATTCTAGCATTT ATACTAGAATGACCTTATATTG ATAAAATGNTTGCTGATTAATTNGTACTCCCTCCTTTCACAATNTAAGTCATTCTAGCATTTTCCNTATTTATATTGATGTTGATGATTCATCAACATCAATATAAATATGGAAAATACTAGAATGACCTTATATTGTGAAACGAAGGAAGTATATATGATCTNCCCGGTACATT CTGATCCATGAGGTGTGGACAGGTTGANAAACACAAAAGATGGCTGCCATAGATTAAAAGAACTATGCCAACTTGTCCATGTACTAGAGCATTAGACAAAGTTAGCTTTGAAGCTGGTGANATGGACAGATGATAAAATGNTTGCTGATTAATTNGTACTCCCTCCTTTCACAATNTAAGTCATTCTAGCATTTTCCNTATTTATATTGATGTTGATGATTCATCAACATCAATATAAATATGGAAAATACTAGAATGACCTTATATTGTGAAACGAAGGAAGTATATATGATCTNCCCGGTACATTTGTTTGGGAAGTAGAGAAGGCTGTAAACTGTACTTANAACCNGGAAAAGAAAACNGAGATAAATAAACGGNATACACTTGTAATCTTTCTTTANANNANNTNAAAAAANTTAAAAAAAAAAAA 2 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 1e-26 osa-MIR809d 0.0000000000006 -68.6 ....((((.(((..(((((.(..(((((((.((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((.((((((((((((((((((((...)))))))))))))))))))).))))))).))))))))).)))).))))))))).)).)).)))))..))))))....)))..)))) (-68.6)