mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGAGGAGGCCGGGACCGCC TGACCCCGGTCTCCTCGCCGG CCGGATCTCCTAGTGAGGAGGCCGGGACCGCCGGATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCCGGCGGATCCG TGGCACGAGGCGCCTCTTGCGCTCGCGTGCGCCGTCGTCGCCGCAGCTCCCTCTCCTCTACTGTGCTGGGCGCCGCCGCTCCCTCCCAATGACCCGCCGGATCTCCTAGTGAGGAGGCCGGGACCGCCGGATCCGGTGACCCCGGTCTCCTCGCCGGCGGATCCGGCGCCCAGACGCCCACCTCCTCCGCTCGCAAGCGCCGTCGCCGCCGCAGCTCCGTTCTCCTCTACCGTGCTGCCACCGCCGCTCCCTCTCTGCGGTGTCAAATATGGCTCGGGGACCATCTGATTCATCAATCTTGGCCTCCCCTCCAGTTGAATCGGTCGCCCGGATGGAGTCAATAGGGTGCCGCCGCTGCCCTCTTCTCCTGTCCCTCTCCGGCCGCCGCCACTGCCATCTTCTCCTCTCCCTCTCCATGA 3 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1846 2e-32 osa-MIR1846a 4e-24 -44.2 .(((((((.((.((((((((((((((..(((((....)))))..)))))))))))))).)).))))))) (-44.2)