mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGATTCGTAGTACTAGGATG TTATAGTACAACGAATCTGGA CCAAAAAGTGAATCTAGCTCTGTATGTGACACATTATAGTACAACGAATCTGGATAGAAATATGTCTAGATTCGTAGTACTAGGATGTGTCGCATCGAGTGTTGGTTTTTTATGGGA AGAGCCCGGCGAGAGACAGGTCGACGCCTCGCGAACACGAGGCATTCGTTGTCCTAGCTGACCATCTCTCCTTCTTCTTCCTCCTGTCGCTCTTGGAGAAGTACACAGCTGTACGCGACGACCCCATGGATATGGTCTACTCCCTCCGTCCAAAAAGTGAATCTAGCTCTGTATGTGACACATTATAGTACAACGAATCTGGATAGAAATATGTCTAGATTCGTAGTACTAGGATGTGTCGCATCGAGTGTTGGTTTTTTATGGGACGGAGGGAGTGGTAATTACTGGCAAAATCATCATCATCTTCTGGTTAATCTTGAGCCCTAACAGTTGATCTACTTAGTGTGATGGCTTGGTTATTATTAGGGATAGGTTTTGTAAAATTTTTGGTGGCAATATAAAGGAGAATTAATGTATGTTTCAAAATGGGGAAGAATTGAAGTAGGTTTCATCCCCCAAGTTGTGTACACACACACTTGCATTTCCATTGTACAGCTGTTATTTATATCATTGTTATATGTGTTTCCTATACAATCAATTATTCAACAGC 2 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 2e-21 osa-MIR814c 0.000006 -50.9 (((.(((..(((((..((((...((((((((((((.((((((.(((((((((((((......))))))))))))).)))))).)))))))))))).))))...)))))))).))).. (-50.9)