mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGAGAGCACA AGCTCTTTCTTCTTCTCTCATT AGCCATGAATCAGTCCGAGATGACAGAAGAGAGAGAGCACACCCACCTGATTACAAGTAACAAAAAACTACCAACTATCAACATTTTGTCTACTATGAAGAAAATCACATGTCTAGACTATAGTTACGAATGGAAGATACATTCAATGATGTTTATGAAAATTTGAGACGGTCGAGGACTATAGTTACTCTATCGCATACATTTAATGACAAAAAAAATTGTGTACTCTTATTTATTTTCAATACATCTTCATTCAATTTCTATGCAAGAATCAAAATGCAGTATAAAAAATTGCATTCAATATCATGGTAAAAAAATTGTTCAAAAAAAGTAAATATCATGGTAAAAAAATCATTAGATTTTGCAATAAGTAAGAGTCAAGTTTTACCTTGTGAGGAATTCCTCCCAACAGAATCATGGGAGCTCTTTCTTCTTCTCTCATTGTGCCCTGCCAGTCTCC 4 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 zma-MIR156j 0.00002 -102.28 ......((..(((..((.(((((.((((((((((((((...((((..(((((...........((((((..............(((((((.....(((......))).((((.((((((((((((..(((((.......)))))..((((((((((....))...)))).))))..))))))))....))))..)))).........))))))).......((.((((((((((((...........................(((((((.((..((((((((.......))))))))...((((((((((........................))))))))))............)))))))))))))))))))))))))))))...(((.((((....)))).)))...))))))))).)))))))).)))))).))))).))..)))....))... (-102.28)