mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA GGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAGGAGCTGGAGCTGCATGGAGATGAATTTTGTGCATATCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACC 1 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 gma-MIR156d 4e-17 -83.2 (((.(.(((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))))))))))))))))(.(((....))).)...............)))))))))).)).)))))))))))))).))))))))).)))) (-83.20)