mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTTTATTCTTCTGTCATCA TGCTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGAAATGCATGGAAGGCAATGGCATCTCATTCCTTTGTGCTCTTTATTCTTCTGTCATCACC 1 1 5' arm Medicago_truncatula mirbase 100 gma-MIR156e 6e-33 -42.4 ...((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((((.((.....))...)))).)))))..))))))))))))).)))))))))).)).. (-42.40)