mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCAAGCATA GTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATATATGAAGCTCATTGAAAAATCAATGACCTTTGTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCC 3 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase mir-160 2e-42 mtr-MIR160b 1e-46 -48.7 ..((((((.(((((((..(((((((((.((..(((.(((((((....))))))).)))..)).)))))))))..))))))).))))))... (-48.70)