mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGATAAACCTCTGCATCCAG GGATGCAGCGGTTCATCGATC AGATGAGGTGAAGTTCGTCACTGGATGCAGCGGTTCATCGATCTGTTCCTGAATTTTGTTTGTCTCGTAAAACAAACATGAATCGGTCGATAAACCTCTGCATCCAGCGCTCACTTTCCCCTCT 2 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase MIR162_2 1e-44 gma-MIR162 0.000000000000002 -51.6 ....((((.(((((..(.(.((((((((((.((((.(((((((.((((.((...(((((((........))))))))).)))).))))))).)))).)))))))))).))..)))))..)))). (-51.60)