mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTA GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG GTTGATGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTAATAACTAACTCAATTTCTTTGTCTTTGAAAGCTTTTCTTTGTTTCACTCTTTTTGATTCTTAGAAAGTTGAAACTAAGTGAGCTTTAAAGGTTTGATTTTGATGTGTGATTATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTACCAAC 4 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-166 3e-92 tcc-MIR166b 0.000000002 -64.4 ((((.((((((((..((((((..(((((((((.....((((((..((....((((((((.((((..(((.((((((..((((((((...)))))))).)))))).))).))))))))))))...))..)))).))...)))))))))..))))))..)))))))).)))) (-64.40)