mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGAACGCAGTCTGGCTCGAGG GCTGAGAGGAACGCAGTCTGGCTCGAGGAATGCTCAGATCTGTTTTGATCTGATCGATATGTTCATATCTAATTAATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCCCATC 4 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-166 1e-53 ptc-MIR166q 0.000001 -44 ..((.((((((.(.(((((((..((((((....(((((((......)))))))..(((((....))))).......))))))..))))))).).)))))).)).. (-44.00)