mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG TTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACGCTTTCTTCTCGATCTAATGCAAATTTGTGGTCATGGATTGTAAAGTATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAAT 4 0 3' arm Medicago_truncatula mirbase mir-166 7e-55 ptc-MIR166c 0.000000000001 -47.4 .(((.((((((((..((((((..((((((..((((.....(((((((.((((....))))....))))))).))))..))))))..))))))..)))))))).))). (-47.40)