mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTTGGTGCTGGTCGGGAA CCCGTCTTGCATCAATCGAAT CTGATTTGCTTGGTGCTGGTCGGGAACCATTACATCCACAGTTTCCGTAGAAACTTTCCCTTAGTAAATTGGACCCCGTCTTGCATCAATCGAATCAG 5 0 5' arm Medicago_truncatula mirbase MIR168 1e-49 100 -36.44 ((((((((.(((((((.((.((((..(((((((......((((((....))))))........))))..)))..)))).)).))))))).)))))))) (-36.44)